1.    개요

 -       Nanostring _ nCounter Analysis System은 prep station과 Digital analyzer로 구성된 system으로 유전자의 발현 정도 및 chromosome variation을정량 하는데 사용되는 시스템으로 한 번의 실험으로 최대 800개의 유전자에 대해 분석을 진행할 수 있다.

2.    원리 

-      nCounter Analysis System은 target specific 하게 작성된 100mer의 probe를 이용하여 target 유전자를 detection 하게 되는데, 100mer의 oligo end에는 각각 biotin과 color-coded barcode를 labeling 한다.

-      나노스트링에서 특허를 갖고 있는 targetspecific reporter probe인 barcode system은 4종류의 dye (Alexa dye 3종류, Cy3)를 길게 늘어트려 barcode 마다 specific signal을 형성할 수 있도록 제작이 되었으며, 최대 800개의 유전자에 대해 specific signal을 형성할 수있도록 제작 되었다.

-      Total RNA 혹은 genomic DNA에 target gene이 포함되어 있을 경우아래와 같이 hybridization 되며, barcode에서생성되는 specific signal을 detect 한 후, 동일 signal을 count 하여유전자의 발현 정도를 정량 할 수 있다.

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-      유전자의 발현량은 count number로 표시가되며, 샘플 내에서 유전자의 발현 정도 및 샘플간의 발현 정도를 비교할 수 있다.